申報辦理餐廚垃圾處理服務資質證書的流程如下：

準備相關材料：包括企業營業執照副本復印件并加蓋公章（三證合一的只需提供一證）、組織機構代碼證正本復印件并加蓋公章（如三證合一則只需提供二證）、稅務登記證原件復印件并加蓋公章、法定代表人證明原件及身份證明復印件、公司章程、驗資報告等文件原件及復印件等。

向相關環境部門提交申請：企業需要向當地環境保護部門或城市管理部門等權責機構提交申請，并繳納一定的申請費用（不同地區費用可能有所不同）。

進行現場審查：申請企業資質的審查評估過程中，審核人員會對企業的現場情況進行檢查，包括垃圾堆放、處置采取的措施、設備標準規范、安全設施、環保政策運營情況以及財務報表等。

獲取資質證書：如果該企業資質的審查評估過程順利并被確定符合相關要求，在一定的工作日內，相關部門會頒發資質證書，資質證書一般有有效期，需要定期進行更新和審核評估。