根據我了解的情況，瑞士對于醫療器械的注冊和許可證頒發采取了嚴格的監管標準。申請二類醫療器械的代辦通常需要以下文件和許可證：

1. 技術文件和產品說明: 詳細描述醫療器械的設計和功能，包括技術規格、用途、材料成分等。
2. 質量管理體系證書: 醫療器械制造商需提供質量管理體系認證，如ISO 13485。
3. 臨床評估報告: 需提供相關的臨床試驗和評估報告，證明產品的安全性和有效性。
4. 風險分析報告: 包括產品使用可能存在的風險，并提出相應的風險控制措施。
5. 注冊申請文件: 涉及產品注冊的申請表格和文件，需要詳細填寫產品信息。
6. 制造許可證或授權代理文件: 如果產品由瑞士以外的地方制造，需要提供相應的制造許可證或授權代理文件。
7. CE標志證書: 證明產品符合歐盟的技術要求和安全標準。
8. 經銷商授權證書: 如果有經銷商或代理商參與銷售，需要提供相關的授權證書。