制備重組III型蛋白敷料的工藝流程包括以下幾個步驟：

設計和合成：根據目標需求，設計和合成全新的重組人源膠原蛋白基因序列。這一步需要選擇水溶性強、生物活性高的部分進行密碼子優化和拼接重組，以得到具有預期功能的重組膠原蛋白。

表達和純化：將合成的基因序列導入合適的宿主細胞中，通過基因工程技術進行表達。表達出的重組膠原蛋白需要進行純化處理，以去除雜質和其他細胞成分，確保產品的純度和質量。

配方和制劑：根據應用場景和目標效果，添加其他活性成分、交聯劑、保濕劑等，以制備成敷料或其他形式的醫用產品。配方和制劑的過程需要嚴格控制成分的比例和混合均勻度，以確保產品的質量和穩定性。

質量控制和安全性評估：對制備得到的重組III型蛋白敷料進行質量檢測和驗證，包括生物學活性、安全性、穩定性等方面的評估。這包括一系列的檢測試驗，如分子量檢測、氨基酸組成分析、生物學活性評估等，以確保產品的質量和安全性。

臨床試驗：在確保產品安全性和有效性后，進行臨床試驗以驗證其在真實場景下的應用效果。這包括對產品的療效、安全性、耐受性等進行評估。臨床試驗是產品研發過程中至關重要的一步，需要設計合理的試驗方案，并進行嚴格的試驗操作和數據分析。

注冊和上市：如果臨床試驗結果良好，那么可以向相關部門申請產品的注冊和認證，之后就可以正式上市。在產品上市前，還需要完成其他必要的步驟，如產品包裝設計、標簽制定等。

以上是制備重組III型蛋白敷料的一般工藝流程，具體過程可能會因產品的具體需求和目標而有所不同。這是一個需要多學科知識和技能的過程，需要不斷的試驗和優化，以確保產品的質量和安全性。