1.投資人數和企業財產歸屬形式不同。個人獨資企業是一個自然人進行的投資，是一個人的行為，企業財產為投資人個人所擁有;合伙企業則不是單個人的行為，它必須由2人以上的合伙人設立，聯合經營，企業財產由合伙人共同所有，并由全體合伙人共同管理和使用。

2.承擔責任不同。個人獨資企業是一個投資人投資，財產和利潤歸該投資者所有，故其對企業承擔無限責任;合伙企業的財產是由各合伙人出資所形成的，在共同經營中要求共擔風險，要求各合伙人對合伙企業的債務承擔無限連帶責任。

3.事務的管理方式不同。個人獨資企業的投資人對企業事務管理具有最終的決定權，投資人獨資出資，獨資經營，自行作出決策;和獲取哦也的設立以各合伙人訂立合伙協議為前提，各合伙人共同出資，共同經營，企業事務管理可以由全體合伙人共同執行，也可以由合伙人約定或者全體合伙人決定，委托一名或數名合伙人執行，重大事項仍然是全體合伙人共同決定。

4.投資轉讓方式不同。個人獨資企業由于不能分離，投資人要轉讓投資或撤回資本，只能通過徹底轉讓企業或者解散企業的方式;而合伙企業的財產轉讓，合伙人既可將其在合伙企業中的財產份額轉讓給其他合伙人或經全體合伙人同意轉讓給合伙人以外的第三人，也可以通過退伙的方式轉讓其財產。