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1、納稅原則先分后稅，合伙企業以每一個合伙人為納稅義務人，先按照一定的比例和方法分配合伙企業的應納稅所得額，再按照分配的應納稅所得額進行納稅。

2、稅種差異合伙企業合伙人是自然人的，繳納個人所得稅；合伙人是法人和其他組織的，繳納企業所得稅；合伙人為合伙企業時，則向上穿透。

3、收益區分合伙企業對外投資分回的股息紅利，不并入企業的收入，而應單獨按“利息、股息、紅利所得”應稅項目計繳個人所得稅。

4、虧損彌補有限合伙企業若有經營虧損，而企業合伙人本身生產經營有盈利的，不得用合伙企業的虧損來沖減本企業的盈利。

5、納稅稅率理論上，自然人合伙人應按5%-35%五級超額累進稅率計繳個人所得稅，實踐中很多地區按20%征收；對于法人和其它組織，適用25%的企業所得稅率（實踐中存在爭議，部分地區免稅，部分地區不免）。

6、納稅時點合伙企業當年的所得，無論是分配與否都要繳稅，一般收益的個人所得稅按年計算，分月或者分季預繳，股息紅利類收益需在取得紅利的次月十五日內申報個人所得稅；法人合伙人應在合伙企業取得紅利的當年，計入企業應納稅所得額，進行企業所得稅年度申報。

7、納稅地點個人所得稅的申報地為合伙企業實際經營管理所在地；居民企業以企業登記注冊地為納稅地點。

8、稅收優惠證券投資基金類合伙企業從新三板掛牌企業取得的股息紅利所得，持股1個月-1年的減按50%計入應納稅所得額，超過1年的免征收個人所得稅，其余合伙企業不免稅。