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蛋白質鑒定就是對蛋白質的特征參數或基本性質進行鑒定，主要包括蛋白質的分子質量、含量、純度、等電點、氨基酸組成和序列、空間結構以及翻譯后修飾情況等，通過這些鑒定得以確定蛋白質的身份ID。不同特征參數所使用的鑒定方法大多不同，也存在同樣的方法可以滿足多種參數鑒定，如質譜法可實現蛋白質的分子質量、含量、氨基酸組成和序列以及翻譯后修飾情況的鑒定，是目前蛋白質鑒定的強有力的工具。電泳技術和液相色譜技術在蛋白質鑒定中也扮演著重要的角色?；旌系鞍椎蔫b定內容和方法與常規的蛋白質鑒定大致相同，只是在利用質譜技術進行混合蛋白質的鑒定時，需要先利用液相色譜或其他技術將各蛋白組分分離開來，再將各組分進行后續鑒定。

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