不能支付的應付款項，不需要繳納增值稅，需要繳納企業所得稅。

財稅[2016]36號文附件1第一條規定，在中華人民共和國境內（以下稱境內）銷售服務、無形資產或者不動產（以下稱應稅行為）的單位和個人，為增值稅納稅人，應當按照本辦法繳納增值稅，不繳納營業稅。

第九條規定，應稅行為的具體范圍，按照本辦法所附的《銷售服務、無形資產、不動產注釋》執行。

而在《銷售服務、無形資產、不動產注釋》中找不到“不能支付的應付款項”相關規定，也不屬于《增值稅暫行條例》規定的銷售貨物、提供修理服務等增值稅應稅范圍。

企業不能支付的應付款項，不屬于增值稅的應稅范圍，是不需要繳納增值稅。

《企業所得稅法實施條例》第二十二條規定，企業所得稅法第六條第(九)項所稱其他收入，是指企業取得的除企業所得稅法第六條第(一)項至第(八)項規定的收入外的其他收入，包括企業資產溢余收入、逾期未退包裝物押金收入、確實無法償付的應付款項、已作壞賬損失處理后又收回的應收款項、債務重組收入、補貼收入、違約金收入、匯兌收益等。

對于確實無法支付的應付款項，應作為企業所得稅的應稅收入（其他收入），計入當期的應納稅所得額，按照規定計算繳納企業所得稅。